(last update: 12.12.2005)

Copyright: Huckenbeck/Scheil: The Distribution of the Human DNA-PCR Polymorphisms, Supplement 98/99/00/01/02/03/04/05

The statistical data in the tables have been calculated using the formulas of Butler [2005; expected heterozygosity (Hexp), polymorphism information content (PIC)], Krüger et al. [1968, power of exclusion (PE)], and Jones [1972; power of discrimination (PD), power of identity (PI)]. Due to the required space, in most publications data on genotype frequencies are missing, so calculations for Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) are impossible. Therefore we used the data given by the authors (+: HWE, -: no HWE, ?: not specified).

 

References:

Butler, J.M. (2005) Forensic DNA typing. Biology, technology, and genetics of STR markers. 2nd ed. Elsevier Academic press, Amsterdam etc., 489-491

Jones, D.A. (1972) Blood samples: Probability of discrimination. J. Forensic Sci. Soc. 12: 355-359

Krüger, J., Fuhrmann, E., Lichte, K.-H., Steffens, C. (1968) Zur Verwendung des Polymorphismus der sauren Erythrocytenphosphatase bei der Vaterschaftsbegutachtung. Dtsch. Z. gerichtl. Med. 64: 127-146

 

 

PENTA D

 

 

 

Europe

Population

Bosnia (autochthonous)

Cyprus (Greek)

Germany (Saxony-Anhalt)

Greece (North)

Hungary (Central, Budapest)

Ref.

(15)

(29)

(19)

(35)

(22)

n

123

1475

207

318

223

Alleles

 

 

 

 

 

2.2

0.0000

0.0120

0.0000

0.0000

0.0000

3.2

0.0000

0.0003

0.0000

0.0000

0.0000

5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

6

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

7

0.0000

0.0080

0.0070

0.0031

0.0090

8

0.0120

0.0140

0.0140

0.0063

0.0200

9

0.2640

0.1750

0.2130

0.2091

0.1950

9.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

10

0.1020

0.1460

0.0890

0.1274

0.1230

11

0.2200

0.1740

0.1550

0.1997

0.1640

11.3

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

12

0.1630

0.1280

0.2630

0.1447

0.2060

13

0.1500

0.2090

0.1880

0.1777

0.1930

13.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

14

0.0570

0.0880

0.0600

0.0802

0.0580

14.1

0.0000

0.0003

0.00000

0.0000

0.0000

15

0.0280

0.0340

0.0100

0.0409

0.0290

15.2

0.0000

0.0007

0.0000

0.0000

0.0000

16

0..0000

0.0060

0.0000

0.0094

0.0020

17

0.0040

0.0007

0.0000

0.0016

0.0000

18

0.0000

0.0007

0.0000

0.0000

0.0000

19

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

20

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

22

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

Σ

1.0000

0.9967

0.9990

1.0001

0.9990

H(exp)

0.8182

0.8484

0.8142

0.8394

0.8356

PE

0.6402

0.6911

0.6307

0.6769

0.6685

PI

0.0575

0.0414

0.0603

0.0463

0.0485

PD

0.9425

0.9586

0.9397

0.9537

0.9515

PIC

0.7937

0.8299

0.7885

0.8189

0.8141

HWE

-

+

+

+

+

 

 

 

Europe

Population

Hungary (Romanies, Baranya county)

Hungary (Romanies, Debrecen region)

Hungary (Ashkenazim, Budapest)

Poland (South-East)

Portugal (pooled)

Ref.

(22)

(22)

(22)

(40)

 

n

206

110

178

203

744

Alleles

 

 

 

 

 

2.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0067

3.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0007

5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0012

6

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

7

0.0000

0.0000

0.0000

0.0025

0.0067

8

0.0000

0.0040

0.0060

0.0049

0.0182

9

0.1160

0.1910

0.1350

0.2414

0.1984

9.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

10

0.2260

0.2230

0.1350

0.1158

0.0935

11

0.3520

0.2270

0.1400

0.1355

0.1777

11.3

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

12

0.0390

0.0860

0.1910

0.2118

0.1749

13

0.1940

0.1500

0.2530

0.1946

0.2066

13.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

14

0.0610

0.1040

0.0510

0.0566

0.0841

14.1

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

15

0.0120

0.0140

0.0870

0.0246

0.0250

15.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

16

0.0000

0.0000

0.0030

0.0123

0.0062

17

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

18

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

19

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

20

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

22

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

Σ

1.0000

0.9990

1.0010

1.0000

0.9999

H(exp)

0.7685

0.8213

0.8332

0.8232

0.8389

PE

0.5592

0.6411

0.6682

0.6478

0.6765

PI

0.0876

0.0567

0.0491

0.0551

0.0465

PD

0.9124

0.9433

0.9509

0.9449

0.9535

PIC

0.7345

0.7966

0.8120

0.7994

0.8184

HWE

-

+

+

+

 

 

 

 

Europe

Population

Portugal (North)

Portugal (North)

Portugal (North)

Portugal (South)

Romania (Bucharest area)

Ref.

(3)

(30)

(32)

(5)

(36)

n

102

291

200

151

139

Alleles

 

 

 

 

 

2.2

0.0150

0.0120

0.0000

0.0000

0.0000

3.2

0.0000

0.0017

0.0000

0.0000

0.0000

5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0060

0.0000

6

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0040

7

0.0000

0.0052

0.0150

0.0033

0.0000

8

0.0250

0.0240

0.0100

0.0133

0.0040

9

0.1910

0.1804

0.2170

0.2133

0.2550

9.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

10

0.0830

0.1220

0.0600

0.0900

0.1330

11

0.2210

0.1564

0.1900

0.1733

0.1730

11.3

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

12

0.1810

0.1839

0.1750

0.1533

0.1650

13

0.2010

0.1787

0.2350

0.2266

0.1760

13.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

14

0.0540

0.1082

0.0650

0.0833

0.0720

14.1

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

15

0.0250

0.0223

0.0250

0.0300

0.0180

15.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

16

0.0050

0.0052

0.0080

0.0066

0.0000

17

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

18

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

19

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

20

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

22

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

Σ

1.0010

1.0000

1.0000

0.9990

1.0000

H(exp)

0.8302

0.8494

0.8221

0.8334

0.8236

PE

0.6621

0.6955

0.6463

0.6661

0.6473

PI

0.0512

0.0412

0.0557

0.0492

0.0551

PD

0.9488

0.9588

0.9443

0.9508

0.9449

PIC

0.8079

0.8309

0.7980

0.8119

0.7997

HWE

+

+

+

?

+

 

 

 

Europe

America, Central

Population

Spain (pooled)

Spain (Central-West, Extremadura)

Spain (Northeast)

Turkey (East Anatolia, Van and Agri area)

Mexico (Hňa hňu, Otomi Amerindians, La Sierra Otomi-Tepehua, state of Hidalgo)

Ref.

 

(4)

(8)

(12)

(17)

n

260

56

204

116

79

Alleles

 

 

 

 

 

2.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

3.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

6

0.0020

0.0000

0.0025

0.0000

0.0000

7

0.0039

0.0089

0.0025

0.0000

0.0000

8

0.0097

0.0000

0.0123

0.0260

0.0063

9

0.1904

0.1964

0.1887

0.2070

0.2215

9.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

10

0.1115

0.1161

0.1103

0.1900

0.2405

11

0.1731

0.2054

0.1642

0.1720

0.1013

11.3

0..0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

12

0.2000

0.2054

0.1985

0.1600

0.1772

13

0.2000

0.1696

0.2083

0.1160

0.2278

13.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

14

0.0942

0.0982

0.0931

0.0910

0.0253

14.1

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

15

0.0135

0.0089

0.0147

0.0340

0.0000

15.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

16

0.0000

0..0000

0.0000

0.0040

0.0000

17

0.0020

0.0000

0.0025

0.0000

0.0000

18

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

19

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

20

0.0000

0.0000

0..0000

0.0000

0.0000

22

0.0020

0.0000

0.0025

0.0000

0.0000

Σ

1.0023

1.0089

1.0001

1.0000

0.9999

H(exp)

0.8322

0.8250

0.8334

0.8423

0.7989

PE

0.6642

0.6567

0.6647

0.6821

0.5987

PI

0.0507

0.0551

0.0498

0.0448

0.0714

PD

0.9493

0.9449

0.9502

0.9552

0.9286

PIC

0.8097

0.8005

0.8113

0.8223

0.7679

HWE

 

+

+

+

+

 

 

 

America, South

Population

Argentina (Buenos Aires)

Argentina (Buenos Aires)

Argentina (Chaco province)

Argentina (Corrientes province)

Argentina (Formosa province)

Ref.

(25)

(39)

(28)

(28)

(28)

n

507

143

55

43

76

Alleles

 

 

 

 

 

2.2

0.0010

0.0070

0.0091

0.0000

0.0066

3.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0066

6

0.0010

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

7

0.0039

0.0105

0.0091

0.0000

0.0000

8

0.0178

0.0210

0.0091

0.0116

0.0197

9

0.1765

0.1853

0.2091

0.1744

0.1974

9.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0066

10

0.1647

0.1853

0.1546

0.1512

0.1908

11

0.1746

0.1503

0.1636

0.2442

0.1579

11.3

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

12

0.1992

0.1748

0.1636

0.1861

0.2105

13

0.1726

0.1853

0.1818

0.1628

0.1382

13.2

0.0000

0.0000

0.0636

0.0000

0.0000

14

0.0651

0.0490

0.0364

0.0581

0.0461

14.1

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

15

0.0138

0.0210

0.0000

0.0116

0.0197

15.2

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

16

0.0079

0.0105

0.0000

0.0000

0.0000

17

0.0010

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

18

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

19

0.0010

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

20

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

22

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

Σ

1.0001

1.0000

1.0000

1.0000

1.0001

H(exp)

0.8369

0.8403

0.8402

0.8223

0.8333

PE

0.6709

0.6782

0.6778